汉为玄菟郡地，南北朝属辽东郡，唐属渤海国，辽属东京道，金属上京路会宁府，元属开元路。清顺治元年（1644年）满清入关，举族迁入中原，此地自此荒废。康熙16年（1677年）被列为封禁之地。光绪23年（1897年）伊通直隶州派员于蒙江境内设置荒务局，招民开垦，百年封禁之地遂宣告废除。光绪三十四年（1908）设蒙江州，民国二年（1913）改蒙江县。1935年2月，伪满州国改省制时，蒙江县（濛江县）划入奉天省。1937年蒙江县划归伪满通化省管辖。

1945年9月，划归冀热辽区辽吉办事处第四专区。lO月，中国共产党接收蒙江县伪政权，11月17日，建立蒙江县民主政府，划归辽东省管辖；辖5个区：县城、头道花园、榆树川、龙泉镇、那尔轰。1946年1月，濛江县划归吉辽省通化分省管辖。1946年2月14日，为纪念在此牺牲的东北抗日联军总司令杨靖宇将军，易名为靖宇县，隶属于东辽省；安东省政府撤到通化后，靖宇县划归安东省通化专区。1946年7月，划归辽宁省通化专区，不久改为辽宁省第一专区。1947年1月20日，辽宁省重组第四专区，驻海龙，辖海龙、辉南、靖宇；7月，区划调整，靖宇县仍为辽宁省第四专区管辖。

1948年2月11日，撤销第四专区，改为辽宁省直辖县；7月30日，靖宇县划归安东省管辖。1949年4月，划归辽东省通化专区；5月9日，划归辽东省管辖，成立靖宇县人民政府。1954年7月23日，靖宇县划归吉林省通化专区。1955年，靖宇县人民政府更名为靖宇县人民委员会。1968年，撤销靖宇县人民委员会，成立靖宇县革命委员会。1980年撤销靖宇县革命委员会，成立靖宇县人民政府。1985年，通化地区行政公署撤销，靖宇县隶属浑江市（现改名为白山市）。

1946年3月，将靖宇县榆树川区所辖的河北屯划归抚松县大营区管辖。1951年，辽东省人民政府批准将靖宇县一区的靖安村、河南村、联合村划出成立濛江镇；全县辖1个镇、5个区。1953年11月2日，经辽东省人民政府批准，将濛江镇改为城关区。1956年3月15日撤区设乡，全县设1个镇、15个乡。1958年3月31日，撤销永生、联合、复兴和沿江4个乡，将其分别并入邻近乡（镇）之中。

1958年9月19日，全县实行人民公社化，划分为1个镇、8个乡（社），即靖宇镇、靖宇乡、花园口子乡、榆树川乡、红升（燕平）公社、幸福（龙泉）公社、红旗（那尔轰）公社、光辉（双山）公社、三道湖乡，44个农业社；后又调整为8个公社、39个管理区。1959年2月21日，幸福、光辉、红旗、红升4个公社更名，全县公社名称一律冠以地名；2月25日，撤销三道湖乡，建立地方国营靖宇县三道湖林场。

1960年4月10日，将燕平公社并入花园公社，双山公社并入靖宇公社；11月，撤销镇制，全县划分为7个公社。1962年，增设永生公社和景山公社；全县辖1个镇、8个公社。1964年，设立三道湖镇；全县辖2个镇、8个公社。1971年，靖宇县辖10个公社，72个生产大队。1977年，由那尔轰公社分出一部分设立西南岔公社，由那尔轰公社、永生公社划出五个屯，与白山电站水库淹没区搬迁后新建的六个屯合并设立赤松公社，由靖宇公社分出一部分设立东兴公社。1980年初，靖宇县辖2个镇、11个公社，96个生产大队，210个生产小队。

1983年，将公社改为乡，调整后全县辖2个镇、11个乡。1984年，经吉林省政府批准，撤销那尔轰乡、花园口乡和龙泉乡，设那尔轰镇、花园口镇和龙泉镇。1985年11月12日，经吉林省政府批准，撤销景山乡，设立景山镇；撤销西南岔乡，设立西南岔镇；撤销靖宇、永生两乡，将其原管辖的行政区域全部划归靖宇镇管辖。调整后辖7个镇：靖宇镇、三道湖镇、花园口镇、那尔轰镇、龙泉镇、西南岔镇、景山镇，4个乡：东兴乡、赤松乡、燕平乡、榆树川乡。1988年12月29日，经吉林省政府批准，设立濛江乡（一说1988年设靖宇乡，1990年改濛江乡）。

1995年12月，靖宇县面积3094.4平方千米，人口约14.9万人。辖7个镇、5个乡：靖宇镇、三道湖镇、花园口镇、西南岔镇、龙泉镇、那尔轰镇、景山镇、榆树川乡、燕平乡、东兴乡、赤松乡、濛江乡。共有27个居委会、130个行政村。县政府驻靖宇镇。

2000年第五次人口普查，靖宇县总人口141120人，其中：靖宇镇53695人、三道湖镇6898人、龙泉镇9625人、那尔轰镇9234人、花园口镇10945人、景山镇8679人、西南岔镇8394人、榆树川乡6962人、燕平乡4393人、东兴乡3145人、赤松乡6502人、濛江乡12648人。

2001年7月13日，吉林省民政厅下发吉民行批[2001]4号文件，经省政府批准，撤销东兴乡，将其所辖行政区域划归三道湖管辖。乡镇合并后，镇政府驻地不变。2002年，靖宇县总人口14.5万人。其中非农业人口6.4万人。辖7个镇、4个乡。

2003年底，靖宇县面积3094平方千米。总户数46893户，总人口14.4万人，其中农业人口7.8万人，占人口总数的54.2%。辖7个镇、4个乡：靖宇镇、三道湖镇、花园口镇、西南岔镇、龙泉镇、那尔轰镇、景山镇、榆树川乡、燕平乡、赤松乡、濛江乡，共有111个行政村。

2005年2月5日，吉林省民政厅下发吉民行批[2005]3号文件，经省政府批准，同意撤销榆树川乡，将其所辖行政区域划归花园口镇管辖；撤销西南岔镇，将其所辖行政区域划归景山镇管辖。以上乡镇合并后，乡镇政府驻地不变。2005年10月18日，吉林省民政厅下发吉民行批[2005]37号文件，经省政府批准，同意撤销燕平乡，将所辖行政区域划归三道湖镇管辖。